A microscopia permanece como uma ferramenta essencial no diagnóstico microbiológico, especialmente pela sua rapidez, baixo custo e aplicabilidade em diferentes contextos. Este curso teórico-prático tem como objetivo os fundamentos da execução das principais técnicas de bacterioscopia e baciloscopia utilizadas na rotina laboratorial. Serão abordados os princípios da microscopia óptica, preparo de lâminas a partir de amostras clínicas e culturas bacterianas, bem como a execução das técnicas de coloração de Gram e Ziehl-Neelsen. O curso também enfatizará a interpretação dos achados microscópicos, incluindo morfologia bacteriana, arranjos celulares, presença de células inflamatórias e artefatos, com discussão de casos.

O sequenciamento completo de genomas (Whole Genome Sequencing – WGS) tem se consolidado como uma ferramenta estratégica para o diagnóstico microbiológico, vigilância epidemiológica e investigação de surtos bacterianos. Este curso abordará os principais conceitos e aplicações do WGS na microbiologia clínica, apresentando fundamentos das tecnologias de sequenciamento de short e long-reads, estratégias de montagem genômica e etapas essenciais de análise bioinformática de genomas bacterianos.
Serão discutidas aplicações práticas do WGS para caracterização genotípica de isolados clínicos, incluindo predição de resistoma, viruloma e plasmidoma, além de abordagens filogenômicas para investigação de transmissão clonal e vigilância de patógenos. O curso também apresentará uma introdução às aplicações da metagenômica clínica e às perspectivas do sequenciamento genômico no diagnóstico microbiológico moderno.

O curso será teórico-prático (com realização e interpretação de testes de detecção de mecanismos de resistência) e fornecerá conhecimentos essenciais para que o microbiologista/pesquisador compreenda e aplique na rotina laboratorial (clínica ou de pesquisa) os documentos, regras e normas do BrCAST (Comitê Brasileiro de Testes de Sensibilidade aos Antimicrobianos) para a realização/intepretação dos testes de sensibilidade e de detecção de mecanismos de resistência. Abrangerá desde metodologias de realização até a interpretação e liberação dos testes de sensibilidade aos antimicrobianos e, em especial, detecção de mecanismos de resistência aos antimicrobianos em bactérias Gram-negativas e Gram-positivas. Haverá atualização sobre novos antibióticos e novos mecanismos de resistência aos antimicrobianos. Laboratórios de microbiologia clínica e de pesquisa em microbiologia devem conhecer as orientações do BrCAST para garantir laudos e resultados de pesquisa acurados, fundamentados e robustos. O Curso oferecerá a oportunidade de aprender e discutir com especialistas em resistência bacteriana aos antimicrobianos e membros/representantes do BrCAST. Todo o curso será realizado dentro do Laboratório de Microbiologia da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - Universidade de São Paulo (FCFRP-USP).

O curso será teórico-prático, apresentando os principais equipamentos e tecnologias utilizados na rotina do laboratório de microbiologia hospitalar, incluindo: identificação de microrganismos por Ionização/Dessorção a Laser Assistida por Matriz - Tempo de Vôo (MALDI-TOF), sistema automatizado para identificação microbiana e testes de sensibilidade aos antimicrobianos, painéis sindrômicos, hemoculturas automatizadas, cultura automatizada de micobactérias e PCR em tempo real para detecção de Mycobacterium tuberculosis e resistência à rifampicina. O Curso oferecerá a oportunidade de aprendizado e discussão com especialistas, além do contato próximo e práticas relacionadas ao uso destes equipamentos.

O curso vai abordar o diagnóstico laboratorial de gonorreia, sífilis, e infecções por Chlamydia trachomatis e Mycoplasma genitalium, correlacionando as possibilidades de diagnóstico com as características do microrganismo e das doenças às quais estão relacionados. Serão comentados aspectos de boas práticas de amostragem; bem como apresentadas as fundamentações, potencialidades e limitações de testes rápidos e moleculares aplicados no diagnóstico destes microrganismos. Especial atenção será dado ao algoritmo para o diagnóstico de sífilis e ao isolamento e realização de teste de susceptibilidade aos antimicrobianos (TSA) de Neisseria gonorrhoeae, temas que serão complementados com abordagens práticas. As aulas serão fundamentadas em Protocolos e Diretrizes do Ministério da Saúde do Brasil, tendo o BrCAST como referência para avaliação de TSA.